Genomic and Proteomic Group

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본 연구실(FPSB: Function Proteomics and Systems Biology)에서는 줄기세포 분화와 암, 당뇨 등 여러 병인을 유도하는 단백질과 이와 관련된 여러 인자(protein, RNA, DNA)간의 상관관계를 밝히는 연구를 하고 있습니다. 이러한 연구를 수행하기 위해서 단백질의 위치변화 및 이와 상관성이 있는 protein, RNA, DNA 간의 상호작용의 변화를 예측할 수 있는 알고리즘을 개발하고, 이를 연구대상에 적용한 후 confocal, FCCS(Fluorescence Cross Correlation Spectroscopy), TIRF(Total Internal Reflection Fluorescence microscope)등의 molecular imaging 방법을 이용하여 live cell에서 이를 검증함으로써 줄기세포 분화 또는 질병유발 바이오마커를 개발하는 연구를 진행하고 있습니다.

이후근 교수 연구실에서는 생명현상을 종합적인 단백질 발현양상으로 설명하는 단백체학 연구를 질량분석기와 생물정보학에서 개발된 연구방법들과 전통적인 세포생물학 연구방법을 조합하여 진행하고 있습니다. 현재 진행 중인 연구로는
1) 조기진단 바이오마커 발굴을 위한 비표지 정량분석법을 이용한
유방암 환자 조직의 당쇄화 단백체 분석 연구
2) 세포 내 발현된 단백질들의 활성 등을 조절하는 인산화 단백체의
분석을 기반으로 하는 기전 연구
3) 대장암 환자의 조직 분석을 통한 마커 발굴 연구
4) 위와 같은 분석을 성공적으로 수행하는데 필요한 초미세관
크로마토그래피법과 질량분석법의 개발 등입니다.

현재 본 연구팀에서는 정상배란 주기(Natural cycle)에 의한 난자 성숙(oocyte maturation)에 관여하는 Follicular fulid의 성분과 다수의 성숙난자를 얻기 위해 과량의 gonadotropin 투여 후의 follicular fulid의 성분의 비교를 통해서 ovarian capacity가 정상적인 환자들에 있어서는 최적의 oocyte quality, embryo development and improved implantation rate에 관하여 바이오마커를 추적함과 동시에, ovarian function에 문제가 있는 Ovarian hyperstimulation syndrome and polycystic ovarian syndrome과 같은 증상의 원인을 규명하기 위한 목적으로 당쇄화 단백체 분석 연구를 진행 중입니다. 또한 효과적인 당쇄화 단백체 분석을 위하여 1nm 사이즈의 나노입자를 이용한 당쇄화 단백체 분리법을 개발하는 연구를 수행하고 있습니다.

본 연구실은 유전체 및 유전체 의학 연구에 초점을 맞추고 있으며, 현재 국내 최대 규모의 차세대 시퀀싱 시설을 갖추고 있습니다.
차세대 시퀀싱을 이용하여 Human genome sequencing과 cancer genomics, pharmacogenomics 연구 및 mRNA-SEQ, miRNA-SEQ, CHOP-SEQ을 이용한 연구를 수행하고 있습니다.

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